Česnek kuchyňský napadá celý komplex virů. Nejsledovanějším virem je žlutá zakrslost cibule – Onion yellow dwarf virus (OYDV), který společně s Leek yellow stripe virus (LYSV) patří do rodu Potyvirus. Dalším významným rodem je Carlavirus, do kterého patří Garlic common latent virus (GCLV) či Shallot latent virus (SLV). Identifikovány byly také viry rodu Alexvirus. Na listech napadených rostlin se objevují žluté ohraničené pruhy. U některých odrůd česneku se může vyskytovat symptomová latence. Ta je typická např. pro tzv. ruské česneky, které i přes své napadení nevytvářejí na listech žlutou mozaiku. Virová onemocněné mohou snižovat výnosy o 20–60 %. Z toho důvodu se v posledních desetiletích zvyšuje snaha ozdravovat česnek od těchto virů.